Passaram-se onze anos desde a introdução da Internet-Conectada, usando-se óculos de realidade virtual, Yuko Okonogi se muda com sua família para a cidade de Daikoku, o centro tecnológico de ameaças ''Half-Virus'' do mundo. Yuko se junta á Agencia de investigação de sua vovó, que tem crianças equipadas com ferramentas virtuais e poderosas metatags. Rapidamente ela se depara com Yuko Amasawa, a hacker expert em ambientes virtuais, que está à procura do computador que fabrica os vírus que se localiza em um espaço corrompido inacessível.